五臺山的植物共有99科、351屬、595種。其中,草本植物482種,占總數的81.3%;喬灌木113種,占總數的18.7%。低等植物中,藻類有地皮菜可供食用,綠藻可作飼料;菌類有木耳、蘑菇、馬勃、豬苓、茯苓,均可入藥,木耳、蘑菇又是山珍佳肴。高等植物中的蕨類有瓦松卷柏、銀粉、背蕨,無為藥材。其余高等植物分牧草、森林、果木、藥材、花卉等。
1.木質植物 五臺山森林資源豐富,森林面積33.7萬畝,覆蓋率8.66%,其中天然林占63%,人工林占37%。森林群落主要由木本植物——喬灌木組成。植物群落因海拔變化呈一定規律性,即亞高山分布著耐寒矮小的高山草甸灌木,中山、低中山分布著高大的針闊葉樹種及伴生灌木。木質植物資源共42科,79屬,131種,其中喬木60種,灌木71種。
2、野生草本植物 大部分是天然牧草,草地面積384.4萬畝,占全省天然草地的7%,加之五臺山水流多,水質好,成為理想的夏季天然牧場。野生草本植物共470多種,其中產量高、品質好的有58種,是五臺山的主要牧草資源。野生草本植物類型有亞高山草甸、高中山地草甸、低中山地草甸。
3、野生花卉 五臺山野生花卉是佛國勝景的特色景觀。夏天的五臺山,花團錦簇,欣賞萬花競放的景致,是到五臺山旅游難以忘懷的享受。野生花卉分木本、草本兩種,馳名的品種有30余種。
4、藥材 五臺山是全國不可多得的藥材園。五臺山所產野生藥材,按藥用功效,可分為15類:解表、去風濕、去濕利尿、芳香化濕、清熱、理氣溫里、化痰止咳、理血、止痛、安神鎮靜、助消化、殺蟲驅蟲、補益、固澀、外用。
5.動物 現有野生獸類41種,6目,19科。主要有石貂、金錢豹、狐貍、獾、黃鼠、山羊、野豬等,都是具有重要經濟價值的皮毛獸。鳥類有142種,16目,36科。其中有9種為山西省所罕見,即黃斑葦雞、栗葦雞、紅胸田雞、鳳頭麥雞、赭紅尾鴝、白項溪鴝、黑眉葦鶯、棕肩尾菅、黑尾蠟嘴雞。
6、礦藏資源 五臺山蘊藏著極為豐富的礦藏資源。據勘察,金屬、非金屬礦藏有30余種,礦點160余個。其中尤以鐵礦為多,以沉積變質型(鞍山式)鐵礦床為主,分布境內五臺縣、繁峙縣、代縣、原平市一帶,通稱五臺鐵礦。銅礦主要有臺懷、觀音洞、虎山、葦地坪銅礦等。金礦有五臺鎮海寺、繁峙寬灘、代縣張仙堡、灘上等地的巖金,張仙堡、峨口等地的白砂金,均已開采。此外,還有硫鐵礦、稀土元素礦、鈾礦、綠柱石礦、水晶礦、云母礦、硼礦、大理石礦和花崗巖礦等。